哺乳动物胚胎发育的特点是细胞快速增殖和多样化。在几周内,一个单细胞就能分裂成数以百万计的细胞,并生成各种各样的功能分子。尽管哺乳动物体内发育的主要构成细胞轨迹已有大量研究,但对该过程进行全面描述仍然难以实现。美国华盛顿大学研究团队提出了系统重建小鼠整个胚胎发育的细胞轨迹。该研究结果于近日发表在《Nature Genetics》上,题为:Systematic reconstruction of cellular trajectories across mouse embryogenesis。
研究人员整合了几个单细胞RNA测序数据集,这些数据集覆盖了小鼠的胃肠发育和器官形成过程,并补充了来自胚胎大约第8.5天的约15万个细胞核的分析数据。总的来说,研究人员定义了从胚胎第3.5天到第13.5天连续19个阶段的细胞状态,并将它们与可能的祖先和后代建立联系。该过程通过自动化程序构建。尽管如此,由此产生的有向无环图(trajectories of mammalian embryogenesis,哺乳动物胚胎发育的轨迹)与现在对哺乳动物发育的理解认识一致。
综上所述,研究人员利用TOME系统地筛选出一些转录因子作为每种细胞发育的候选调控因子,为胚胎发育的研究提供了新思路。
论文链接:
https://www.nature.com/articles/s41588-022-01018-x
注:此研究成果摘自《Nature Genetics》杂志,文章内容不代表本网站观点和立场,仅供参考。