燕麦作为六倍体作物具有基因组大、重复序列含量高等特点,其基因组测序组装一直是世界性难题。近期,以四川农业大学和吉林省白城市农业科学院为核心的燕麦研究团队构建了六倍体裸燕麦高质量基因组图谱,相关成果在《Nature Genetics》发表,论文的标题为“Reference genome assemblies reveal the origin and evolution of allohexaploid oat”。

研究团队以我国裸燕麦起源中心的燕麦品种为材料,设计选用了高精确度测序的超长测序技术,选择了栽培燕麦最可能的四倍体和二倍体祖先一起构建其基因组作为参照,结合不同技术手段绘制出10.7Gb大小的燕麦基因组21对染色体的分子图谱,注释出12万多个蛋白编码基因,获得了裸燕麦的高质量参考基因组。该研究通过进一步选择可代表燕麦属现存所有基因组类型的物种,结合全基因测序、叶绿体基因组和转录组分析技术,深入探究六倍体燕麦的起源与亚基因组进化。

该研究作为燕麦研究迈入基因组时代的第一步,代表了植物基因组学特别是谷物基因组学的重大进展,在提升国内燕麦产业竞争力、保障粮食安全、推动选育优质燕麦优良品种等方面具有重要意义。

论文链接:

https://www.nature.com/articles/s41588-022-01127-7

注:此研究成果摘自《Nature Genetics》期刊,文章内容不代表本网站观点和立场,仅供参考。